卫生部、国家中医药管理局联合下发《中医药防治手足口病临床技术指南(2009年版)》，指导各地应用中医药防治手足口病。
如何预防指南建议，疾病流行期间，婴幼儿应注意勤洗手，避免到人群聚集的公共场所；居处宜多通风，勤晒衣被；家长也应注意个人卫生。患儿饮食宜清淡,宜服用梨汁、苹果汁、西瓜汁、荸荠汁等，不宜食用辛辣食物，不宜食用“发”物。
针对“国家指南”提出的两个预防方(附后)，广东省中医院儿科专家廖若莎说，两个预防方也适用于广东本地。她提醒，抗病毒口服液、板蓝根冲剂药性偏凉，体质虚寒的小孩不宜多喝，可改吃生薏米扁豆，调理脾胃,预防疾病。
还有中医专家推荐,可将金银花、茵陈、冬瓜、扁豆放入水中,煮开后当茶连续饮用几天，大人、孩子都可防病。
“国家指南”两个预防方
1.白菊花6克，生甘草3克，生山楂10克
以沸水200毫升浸泡后加冰糖适量频饮。适用于素有内热的小儿。
2.生薏米10克，扁豆10克
加冰糖适量，煮粥调服。适用于素有脾胃虚弱的小儿。
上述两方剂量适用于3—5岁小儿，应在医生指导下使用。