服务器虚拟化节约了电能和硬件开支，但同时带来了管理问题。越来越多的软件可以帮助解决这一问题。
在数据中心开展虚拟化的益处是：由于虚拟机器比标准硬件的配置速度快，可以将数百个虚拟机放在十几台物理服务器上运行，在提高效率的同时节约了电能和硬件支出。但是，由于有的公司虚拟化规模过大，开展速度过快，管理问题便很快凸现。最大的问题是：用户不清楚某一应用软件与其他应用软件之间会不会发生硬件和存储资源的冲突。而这将影响企业的IT的能力，同时影响服务水平。
为了缓解这一问题，专家建议用户使用平衡工作量和应用软件服务水平管理的工具，如Akorri公司新推出的BalancePoint。BalancePoint可以显示出某一特定的虚拟机什么时间以及为什么性能没达到标准;基于这一数据，用户可以将工作量进行再次分配以提高效率。这一工具可从VMware和存储区域网络(SAN)的角度进行绩效分析，从而避免了虚拟机因为资源分配不平衡而出现问题。
IDC的分析师Elliot说，几乎所有开展服务器虚拟化的公司都将遇到管理问题，其中就包括工作量平衡以及“虚拟机扩张”和灾难恢复计划的问题。VMware的工具以及越来越多的第三方供应商提供的产品可帮助解决这一问题。